地中3040キロメートル。我々地中調査団の記念すべき地下基地の座標である。
ここ数年地上でのクリーチャーの大量発生、大気汚染などで人々の居場所が徐々に絞られている。政府はその問題を打開すべくこの計画を打ち上げた。

地下に眠るおよそ60世紀以上前の遺跡に地上の人々を一時避難させる。
そして地上がまた安定すれば徐々に人口を地上に戻すという計画だ。

これは私たち第3地下入洞遺跡調査団の遺跡をめぐる壮絶な物語である。