ストーリーは、主人公のタンク機関車“トーマス”がイタリアの鉄道で活躍するという内容。イタリアでは緑の小型タンク機関車“ジーナ”、白い小型のパワーショベル“エスター”、水陸両用車“ステファノ”と知り合う。イタリアでは考古学遺跡発掘現場で働くが、そこで消えた機関車の噂を聞く。