ストーリーは、ウィリアム・シャトナー扮する主人公の宇宙船艦長“ジェームス・Ｔ・カーク”が惑星ジェネシスに向かうという内容。惑星ジェネシスはテラフォーミングによって変化した惑星だった。しかし不安定な元素によってテラフォーミングは劇的に変化を続け、惑星崩壊へ突き進む。惑星ジェネシスに埋葬されたヴァルカン人“スポック”はテラフォーミングの影響で復活し、主人公は“スポック”の救出に向かう。