ストーリーは、佐藤健扮する主人公の剣術家“緋村剣心”が神谷活心流道場に居候するという内容。幕末に暗殺者“人斬り抜刀斎”とあだ名された主人公は明治維新後旅に出る。ひょんなことから神谷活心流道場師範代“神谷薫”と知り合い、道場で暮らし始める。神谷活心流道場周辺一帯の井戸に投入された毒物の一件を契機に、事件の黒幕“武田観柳”の屋敷に乗り込む。

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