ストーリーは、主人公の元人気歌舞伎役者“早乙女アルト”が戦闘機パイロットを目指すという内容。巨人種族ゼントラーディとの戦争後、昆虫型宇宙生物「バジュラ」の襲撃を受ける。主人公は可変戦闘機「VF-25 メサイア」などを操縦士、昆虫型宇宙生物「バジュラ」と戦う。