ストーリーは、ジョン・ヘダー扮する主人公の高校生“ナポレオン・ダイナマイト”がメキシコからの転校生“ペドロ”の生徒会長立候補を応援するという内容。主人公はアイダホの田舎の高校での生徒会選挙で選挙活動やダンスパーティーを過ごして行く。