ストーリーは、テイラー・キッチュ扮する主人公のアメリカ海軍将校“アレックス・ホッパー”が謎のエイリアンに立ち向かうという内容。国際ビーコンプロジェクトによって宇宙に送信された信号に呼応して、エイリアンが巨大な構造物に乗って飛来する。エイリアンは破壊の限りを尽くし始めるが、主人公は何とかエイリアンの弱点を見つけようと画策する。