ストーリーは、マーラ・ウィルソン扮する主人公の小学生“マチルダ”が超能力を得て行くという内容。主人公は知識欲旺盛で書籍好きだったが、家族、小学校校長とも非協力的。逆に家族、小学校校長は主人公の向学心を削ぐようなことばかり。主人公は次第に怒りを溜め込み、いつしか超能力に昇華されて行く。主人公の超能力は獲得当初制御困難な能力だったが、次第に自在に操れるようになる。