ストーリーは、アーロン・テイラー＝ジョンソン扮する主人公の海兵隊員“フォード・ブロディ”が巨大生物“ムートー”に立ち向かうという内容。日本の雀路羅（ＪＡＮＪＩＲＡ）市で見つかった巨大な繭を極秘研究機関“モナーク”が管理していた。しかし、巨大な繭は羽化し、巨大生物“ムートー”として飛び立っていく。