ストーリーは、田中健扮する主人公の東都日報記者“牧吾郎”がゴジラの復活を取材するという内容。ゴジラはソ連原子力潜水艦、静岡県の井浜原子力発電所を襲い、力を蓄えていく。自衛隊はハイパワーレーザービーム車、首都防衛移動要塞スーパーＸなどを使ってゴジラに応戦する。