ストーリーは、ジェイ・コートニー扮する主人公の抵抗軍兵士“カイル・リース”がサイバーダイン社の巨大コンピュータシステム「スカイネット」破壊に挑むという内容。主人公は「スカイネット」が機械軍で人間を攻撃する前の２０１７年にタイムトラベルし、「スカイネット」誕生を阻む計画を立てる。しかし、そこには液体機械兵士T-1000が立ちはだかる。